कौमार भृत्य विभाग भारतीय चिकित्सा केन्द्रीय परिषद के मानकों के अनुसार 14 विभागान्तर्गत महाविद्यालय में कौमार भृत्य विभाग पृथक से संचालित है। इस विभाग में सुव्यवस्थित म्युजियम है, जिसमें चार्टस एवं मॉडल, अध्ययन की सहायक सामग्री के रुप में उपलब्ध है। विभाग में एक विभागीय पुस्तकालय उपलब्ध है। विभाग में छात्रो के अध्यापन हेतु एलसीडी प्रोजेक्टर तथा कम्प्यूटर द्वारा छात्रों को इन्टरनेट के माध्यम से भी अद्यतन जानकारी से अवगत कराया जाता है। महाविद्यालय से सम्बद्ध चिकित्सालयों में बहिरंग एवं अंतरंग विभाग संचालित है, जिसमें रोगियों का स्वास्थ्य परिक्षण एवं मुख्य रुप से बालशोष, स्मृतिहा्रस, कृमि, जीर्ण प्रतिश्याय, कुपोषण, बच्चों की अल्प विकास, एनिमिया आदि विकृतियों की विषय विशेषज्ञों द्वारा चिकित्सा सुविधा उपलब्ध कराई जाती है। समय-समय पर केम्पो का आयोजन किया जाता है तथा निकटस्थ विद्यालयों में जाकर विद्यार्थियों का स्वास्थ्य परिक्षण किया जाता है। बालरोग बहिरंग विभाग में रोग प्रतिरोधक क्षमता हेतु स्वर्णप्राशन संस्कार पर कार्ययोजना तैयार की जा रही है।